پيوندهای پژوهشگاه علوم و فناوری اطلاعات ايران در سه مقولهء اصلی دسته‌بندی شده‌اند؛

» سايت‌های وابسته:
   شامل پايگاه‌های وب كميسيون‌ها، انجمن‌ها و ديگر سازمان‌هایی كه پژوهشگاه با آنها وابستگی يا پيوند سازمانی داشته و يا در طول فعاليت خود در آنها عضويت و يا با آنها همكاری داشته است. در مورد هريك از پايگاه‌ها نوع همكاری  و عضويت پژوهشگاه در قالب  متولی، عضو، ميزبان پايگاه وب يا دبيرخانه و ... توضيح داده شده است.

» سايت‌های ايرانی:
   نرم‌افزار سايت‌های ايرانی راهنمای وب‌سايت‌های مختلف دانشگاهی، علمی، دولتی، خبری، آموزشي، خدماتی و ... است. در اين نرم‌افزار علاوه بر امكان جستجو بر اساس مقوله‌های يادشده، امكان پيشنهاد اضافه كردن وب‌سايت برای دارندگان پايگاه‌های وب ايرانی وجود دارد. پايگاه‌های پيشنهادشده در صورت هماهنگی با اصول و ظوابط پايگاه‌وب پژوهشگاه به سياهه‌ء سايت‌های ايرانی اضافه می‌شوند.

» ديگر پيوندها:
  ديگر پيوندهای مفيد برای كاربران پژوهشگاه.